MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019699	AGC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019699	GCA	2	6	52	57	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019699	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019699	ATCT	2	8	131	138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019699	A	7	7	144	150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019699	CGC	2	6	161	166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019699	TCAA	2	8	188	195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019699	CTG	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019699	TC	3	6	3220	3225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019699	AAT	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019699	TTTG	2	8	3305	3312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019699	AG	3	6	5931	5936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019699	ATT	2	6	5983	5988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019699	GCG	2	6	6100	6105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019699	AC	3	6	6141	6146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019699	CTAA	2	8	6154	6161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019699	A	6	6	6188	6193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019699	GCT	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019699	GCT	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019699	TTG	2	6	7500	7505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019699	ATCG	2	8	7513	7520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019699	TCT	2	6	7529	7534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019699	GGT	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019699	AAC	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019699	ACTT	2	8	7606	7613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019699	ATCT	2	8	7669	7676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019699	T	6	6	7746	7751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019699	AAC	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019699	TAG	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019699	TAT	2	6	9053	9058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019699	CGAT	2	8	9072	9079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019699	TC	3	6	9802	9807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019699	GCTT	2	8	9840	9847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019699	GTA	2	6	9855	9860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019699	AAAT	2	8	9884	9891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019699	CTT	2	6	9912	9917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019699	CT	3	6	9962	9967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019699	CAG	2	6	9975	9980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019699	ACTTT	2	10	9981	9990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019699	A	8	8	10032	10039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019699	A	6	6	10774	10779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019699	GAT	2	6	12550	12555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019699	GCAAC	2	10	12706	12715	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019699	TTA	2	6	12772	12777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019699	TCT	2	6	12793	12798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019699	CT	3	6	12797	12802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019699	ACA	2	6	12828	12833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019699	GTAG	2	8	16691	16698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019699	CTG	2	6	18271	18276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019699	T	6	6	18351	18356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019699	AATT	2	8	18364	18371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019699	TATT	2	8	18373	18380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019699	ATA	2	6	18452	18457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019699	ATA	2	6	18504	18509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019699	A	6	6	18532	18537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019699	TAG	2	6	18560	18565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019699	CA	3	6	18574	18579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019699	ATT	2	6	18595	18600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019699	TTCAA	2	10	18609	18618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019699	AGTG	2	8	18624	18631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019699	CCAA	2	8	19179	19186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019699	GAAA	2	8	19220	19227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019699	TGTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019699	CTC	2	6	19303	19308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_019699	GCT	2	6	19729	19734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019699	TC	3	6	19743	19748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019699	CCAATC	2	12	19782	19793	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019699	TCT	2	6	19802	19807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019699	TCC	2	6	19945	19950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019699	CTT	2	6	20031	20036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019699	TAA	2	6	20038	20043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019699	CTTGG	2	10	20065	20074	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019699	CCA	2	6	20094	20099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019699	TCT	2	6	20102	20107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019699	TCT	2	6	20189	20194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019699	CAAG	2	8	20197	20204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019699	CTG	2	6	20250	20255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019699	TCA	3	9	20277	20285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019699	CGC	2	6	20305	20310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019699	CTG	2	6	20359	20364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019699	CTG	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019699	CCA	2	6	20432	20437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019699	GTCT	2	8	20490	20497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019699	TTC	2	6	20500	20505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019699	TTC	2	6	20512	20517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019699	TTC	2	6	20575	20580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019699	TTG	2	6	20614	20619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019699	AT	3	6	20624	20629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019699	GCT	2	6	20636	20641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019699	CAT	2	6	20694	20699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019699	T	6	6	20868	20873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019699	TAGG	2	8	20944	20951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019699	GCC	2	6	20961	20966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_019699	TCT	2	6	23145	23150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019699	TCGA	2	8	23151	23158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019699	C	6	6	23435	23440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_019699	ATAC	2	8	23449	23456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019699	T	6	6	23533	23538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019699	T	7	7	23556	23562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019699	TCTCT	2	10	25739	25748	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019699	AT	3	6	25801	25806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019699	AGC	2	6	26397	26402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019699	CAC	2	6	26517	26522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019699	ACT	2	6	26566	26571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019699	GAT	2	6	26593	26598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019699	TCA	2	6	26606	26611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019699	AGC	2	6	26701	26706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019699	TAA	2	6	26738	26743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019699	ATA	2	6	26767	26772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019699	CCA	2	6	26804	26809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019699	TAATCA	2	12	26825	26836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019699	TTGAC	2	10	26852	26861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019699	AATG	2	8	26889	26896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019699	GTA	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019699	GTA	2	6	26987	26992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019699	CTG	2	6	27011	27016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019699	TAA	2	6	27040	27045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019699	AAC	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019699	T	6	6	27166	27171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019699	TAA	2	6	27191	27196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019699	GTT	2	6	27215	27220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019699	CTT	2	6	27229	27234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019699	ACG	2	6	27243	27248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019699	TTG	2	6	27260	27265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019699	GCA	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019699	TTG	2	6	27442	27447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019699	TTG	2	6	27455	27460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019699	CATC	2	8	27538	27545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019699	CCG	2	6	27561	27566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019699	CGC	2	6	27682	27687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019699	TGG	2	6	27787	27792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019699	AAG	2	6	27817	27822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019699	ACG	2	6	27828	27833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019699	CAG	2	6	27913	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019699	CAA	2	6	28028	28033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019699	GC	3	6	28036	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019699	CCA	2	6	28066	28071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019699	AGATA	2	10	28095	28104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019699	GAC	2	6	28163	28168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019699	AAT	2	6	28172	28177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019699	ACC	2	6	28227	28232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019699	TGCT	2	8	28256	28263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019699	ACG	2	6	28277	28282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019699	CAT	2	6	28309	28314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019699	ACC	2	6	28317	28322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_019699	TCC	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_019699	ATC	3	9	28389	28397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019699	AGT	2	6	28401	28406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019699	AGGGC	2	10	28414	28423	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_019699	TCA	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019699	GAT	2	6	28484	28489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019699	TGTT	2	8	28653	28660	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019699	CGC	2	6	28702	28707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_019699	TCC	2	6	28813	28818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_019699	CTC	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NC_019699	CCG	2	6	29048	29053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_019699	GAG	2	6	29065	29070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019699	CGC	2	6	29099	29104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_019699	GGC	2	6	29136	29141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_019699	GGCG	2	8	29197	29204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
163	NC_019699	AT	3	6	29207	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_019699	GCG	2	6	29383	29388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_019699	ATG	3	9	29451	29459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019699	ACC	2	6	29469	29474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_019699	ATT	2	6	29517	29522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019699	AGGT	2	8	29704	29711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_019699	TTG	2	6	29723	29728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019699	GGC	2	6	29740	29745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_019699	T	7	7	33991	33997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019699	A	6	6	34064	34069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_019699	T	6	6	34121	34126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019699	CAA	2	6	34127	34132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_019699	AGT	2	6	34153	34158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_019699	AT	3	6	34163	34168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019699	TCAA	2	8	34171	34178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_019699	TCT	2	6	34179	34184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_019699	CTT	2	6	34200	34205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_019699	TAG	2	6	34227	34232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019699	GTA	2	6	37401	37406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019699	ACT	2	6	39312	39317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_019699	ACTG	2	8	40328	40335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_019699	TTGCC	2	10	40376	40385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
191	NC_019699	T	6	6	40534	40539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_019699	TTC	2	6	40541	40546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_019699	TTG	2	6	40871	40876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_019699	ATC	2	6	40944	40949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_019699	GCAA	2	8	41682	41689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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251	NC_019699	AG	3	6	60501	60506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019699	TCT	2	6	61080	61085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_019699	CAG	2	6	64173	64178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_019699	TAA	4	12	64182	64193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_019699	T	6	6	65235	65240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019699	CTA	2	6	65245	65250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_019699	AAT	2	6	65325	65330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_019699	GCT	2	6	65430	65435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_019699	TTAC	2	8	65459	65466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
285	NC_019699	GGC	2	6	65505	65510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_019699	AGT	2	6	65530	65535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_019699	CGAT	2	8	66106	66113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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450	NC_019699	CTT	2	6	104413	104418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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